2019-nCoV研究論文發(fā)表情況

最近網(wǎng)上關(guān)于科研圈的消息大多比較負(fù)面，許多網(wǎng)友狂噴中國專家學(xué)者只想發(fā)論文不想抗疫情，中國SCI體制害人，一些業(yè)內(nèi)大牛專家為了搶發(fā)paper不惜瞞報疫情，毫不顧及大眾的生死。

事實真的是如此嗎?作為一個科研狗還是有很多話想說的：最近這關(guān)于2019-nCoV的文章為何能發(fā)表如此迅速，難道審稿人也在追趕熱點嗎?這兩天的相關(guān)文獻調(diào)研結(jié)果讓我對此事有了不少新的看法。

分析一下新型冠狀病毒究竟出了多少論文?在這個時候發(fā)表這么多論文真的那么必要嗎?我們中國的科學(xué)家在此役中的表現(xiàn)到底怎么樣?

新冠病毒的文章數(shù)量在持續(xù)增長。截至2月5日，在Pubmed上總計找到了69篇相關(guān)研究論文。展示如下：

初步檢索結(jié)果讓人唏噓，這么短的時間里面真的有那么多的重要發(fā)現(xiàn)嗎?仔細(xì)分析，發(fā)現(xiàn)也不是這么解讀的，所謂的學(xué)術(shù)論文真的沒有那么多，真正意義上的學(xué)術(shù)論文哪是那么容易就能發(fā)表的。

學(xué)術(shù)雜志也是雜志的一種，有多種文章類型的，學(xué)術(shù)雜志分為Article、Comment、Editorial、News、Correspondence，Meta Analysis等等，一般而言指的就是學(xué)術(shù)論文，也就是Article，這個是不那么容易發(fā)表的，Article有著非常正規(guī)的結(jié)構(gòu)形式，無論是發(fā)表在哪一個期刊雜志上，基本的結(jié)構(gòu)都必須包含有Abstract，Introduction，Materials and Methods，Results and Discussion以及Conclusions這幾大部分，不是隨便發(fā)點評論，寫點猜想，表達自己的觀點就可以的。正常情況下發(fā)學(xué)術(shù)論文可謂是寫一年投一年，修修補補又一年，總之就是一個煎熬，更不用說像CNS這種頂級雜志。

學(xué)術(shù)雜志圖文詳實，工作量大，一般需要做1-2年實驗才能湊夠一篇文章的數(shù)據(jù)，發(fā)1-2篇5分以上的論文才能博士畢業(yè)。可以想象，學(xué)術(shù)論文的發(fā)表真的沒有那么容易，那么最近這種關(guān)于新型冠狀病毒論文井噴的現(xiàn)象存在什么內(nèi)幕呢?

仔細(xì)分析一下這69篇論文的類型，學(xué)術(shù)論文Article占了45篇，也是占了相當(dāng)大的比例，但實際上它們并不都是正式發(fā)表了的學(xué)術(shù)論文。

這45篇Articles主要分布在bioRxiV、medRxiV、柳葉刀、NEJM、Nature上。雜志的質(zhì)量非常高，可以看出絕對不存在放水的可能性，影響因子也是有高有低，上到頂刊NEJM，下到4區(qū)小刊。不難看出學(xué)術(shù)界也有“追熱點”，這不是什么壞事，各國科學(xué)家都在實驗室里努力幫我國攻克病毒，終歸是好事!

這里面預(yù)印本是個什么概念呢?簡單解釋一下，一般論文發(fā)表的流程是：科研人員把論文投稿給學(xué)術(shù)期刊——期刊審稿——修改——通過——發(fā)表。從你投稿到論文正式發(fā)表，中間審稿、修改到最終發(fā)表見刊可能要幾個月甚至是一兩年的時間。比較著急的情況下，一些重要的研究，科研人員為了提前讓其他研究人員看到自己的研究成果，就會在投稿之后，把論文的Manuscript在“預(yù)印本網(wǎng)站”上公布出來，供同行交流學(xué)習(xí)。BioRxiV、MedRxiV就是倆預(yù)印本網(wǎng)站。

那么45篇Articles里，有多少是發(fā)在預(yù)印本上的呢?有33篇論文，這些都是是已經(jīng)投稿，但還沒有審核通過，所以還不能把它當(dāng)成學(xué)術(shù)界認(rèn)可的科研成果。預(yù)印本上的論文向來良莠不齊，是否真的有研究價值還不能最終確定。這里面也不乏一些不良學(xué)者想蹭熱點，不負(fù)責(zé)任的發(fā)表一些沒有經(jīng)過同行認(rèn)可的研究數(shù)據(jù)，如1月31日印度學(xué)者Bishwajit Kundu和Vivekanandan Perumal發(fā)表的預(yù)印本論文“Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag”，印度學(xué)者一通猛操作，搞得很多不明真相的中國群眾以為病毒是人為制造的。究竟是美國迫害中國的陰謀，還是武漢病毒所的恐怖實驗?在互聯(lián)網(wǎng)上也是激起了不小的風(fēng)波。

但其實他的研究邏輯和方法是完全錯誤的，經(jīng)不起推敲的，完全是憑借自己的臆想撰的文，最后被一大批科學(xué)家聯(lián)手噴到撤稿了?？梢?，科研圈也早已不是一片凈土。

要提醒咱們吃瓜群眾的是：千萬記住：看不懂的東西不要隨便信，更不要隨便噴。

來自世界各地的科學(xué)家，尤其是來自中國的頂尖科研團隊都在爭先發(fā)表論文，會耽誤防控疫情這件大事嗎?我們的專家會為了發(fā)表論文而隱瞞疫情嗎?

首先要說的是科學(xué)家的本職工作就是做研究，疫情到來大家爭先去做相關(guān)科研，雖然有蹭熱點的嫌疑，但是并不為過，我們的專家都已經(jīng)是院士這個級別了，真的不差這一篇論文，他們什么論文沒有發(fā)表過，所以不用陰謀論的說他們?yōu)榱税l(fā)論文而隱瞞疫情，完全沒有任何必要。

科學(xué)家寫論文的目的，是為了把自己的科研成果共享給全世界的研究人員，讓大家都可以及時更新科學(xué)界對新型冠狀病毒的認(rèn)知水平，讓全世界的科研力量都可以為抗擊病毒做出貢獻。這樣既能集世界學(xué)術(shù)的力量攻克難關(guān)，又能督促國內(nèi)科研不要放慢腳步，完全是一家利好的事情，大家應(yīng)該支持，而不是盲目的反對!

本身而言，發(fā)論文就是科學(xué)家抗擊疫情的工作之一!不要隨便指責(zé)人家發(fā)論文不抗疫情了，這是非常不符合常理的猜忌，就好像為啥沒人責(zé)怪終南山院士成天接受采訪而不去抗疫，這是一樣的道理，我們需要的是每一個人都能夠堅守好自己的崗位，做好自己的本職工作。

新型冠狀病毒2019-nCoV的研究進展

一、2019-nCoV的傳播能力

評價一個病毒的傳染性強弱，有個非常重要的參數(shù)叫基本再生數(shù)R0(basic reproduction number)，表示在自然傳播下，一個患者平均會把疾病傳染給多少個人。一定要注意這是不加管控的情況，如果隔離患者會有效地降低R0。R大于1，表示病例數(shù)會增加;R小于1，表示病例數(shù)減少。R值越大，則意味著疫情控制難度增加。

研究團隊發(fā)現(xiàn)，截至2020年1月23日，全國共確診2019-nCoV病例830例，境外報告9例。在國內(nèi)的830例中，有25例死亡，死亡率為3.0%。2019-nCoV感染的平均潛伏期為4.8天。2019-nCoV和SARS患者從出現(xiàn)癥狀到隔離的平均時間分別為2.9天和4.2天。

用EG法和ML法估計2019-nCoV的R值分別為2.90(95%置信區(qū)間:2.32-3.63)和2.92(95%置信區(qū)間:2.28-3.67);而SARS-CoV的R值分別為1.77(95%CI:1.37-2.27)和1.85(95%CI:1.32-2.49)。

研究團隊觀察到，無論是從發(fā)病到隔離的時間，還是R值，2019-nCoV和SARS-CoV都會呈現(xiàn)下降趨勢。這表明中國采取的嚴(yán)格措施和行動是有效的。

團隊進一步解釋，從得出的數(shù)據(jù)來看，2019-nCoV可能比2003年爆發(fā)的SARS具有更高的流行風(fēng)險。已實施的公共衛(wèi)生措施已顯著降低了2019-nCoV的大流行風(fēng)險。然而，仍需要更嚴(yán)格的控制預(yù)防策略和措施，以遏制其進一步蔓延。

二、2019-nCoV的基因組特征

目前這一類的研究論文是最多的，這里面有一個重要因素是測序本身比較成熟，很多科研機構(gòu)可以在不需要實驗的前提下通過數(shù)據(jù)分析進行一些預(yù)測。

1月23日，中科院武漢病毒所研究員石正麗等人在預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv上發(fā)表論文，從指出了nCoV-2019的原生動物宿主最可能是蝙蝠。研究團隊從5位患者身上提取了nCoV-2019的全基因組序列，發(fā)現(xiàn)這些序列間幾乎完全相同，且與SARS冠狀病毒有79.5%的一致性。此外，nCoV-2019與一種蝙蝠中冠狀病毒的序列一致性高達96%。該團隊指出，2019-nCoV的動物宿主最可能是蝙蝠。研究還發(fā)現(xiàn)，2019-nCoV進入人體細(xì)胞時結(jié)合的受體與SARS病毒的相同，均為ACE2。

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